可以起诉。依据《中华人民共和国合伙企业法》，合伙人应共同承担企业的收益和责任。若你发现合伙人有挪用公款等不当行为，造成账目不清并损害了你的利益，可以先尝试与其协商解决问题。若协商无果，你可以提起诉讼。特别是如果存在犯罪行为，建议及时报警处理，以避免更大的经济损失和合伙人关系的恶化。
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针对合伙人挪用公款的情况，你有权要求对方归还挪用的款项并赔偿相应损失。除了直接与其协商外，你还可以选择提起民事诉讼，维护企业和自身权益。选择处理方式时，要考虑挪用金额的大小、行为的严重程度以及追回款项的可能性等因素，选择最有利于你的方式来解决这一问题。