工程款与工资款性质不同，前者基于承包关系，后者基于劳动关系。根据《劳动法》等规定，工程款是合同价款，工资是员工薪酬。不及时区分可能导致财务混乱，甚至引发法律纠纷。
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工程款与工资款不同。具体操作：1.查看支付依据，工程款依据施工合同，工资款依据劳动合同或薪资约定。2.确认支付对象，工程款支付给承包方，工资款支付给员工。3.核对支付内容，工程款与工程进度相关，工资款与员工工作时长及表现相关。
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区分工程款和工资款，常见方式有查看合同性质及支付对象。若为工程施工合同，则支付的是工程款；若支付给员工，基于劳动关系，则为工资款。根据具体情况选择合适方式。